カフェミュウミュウを襲うキメラアニマを倒したいちごたちは、東京上空を覆う雲を浄化するためにミュウアクアを探すことに。ざくろの感覚を頼りに、地下水道を捜索する。
だがその行く手を阻むエイリアンたちは何かを企てているようで……？
一方、藍沢家に閉じ込められていたみんとは、誓司を説得し、パイが暴走させた大気浄化システムを止めに行こうとしていた。
そして、キッシュの言葉に心乱されていた蒼の騎士＝青山くんは――？